Подтверждение ставки 0% по НДС

Уважаемые коллеги!
Прошу Вас ответить на такой вопрос. Организация -посредник (ООО,КСНО) занимается железнодорожными перевозками (вагонов не имеет). 
По 3-м ж/д накладным следующая ситуация :
1.Ж\д  1 накладная уходит грузополучателю с отметкой выпуск разрешен;
2.Двойка ж/д накладная остается в архиве таможни с отметкой выпуск разрешен;
3.Тройка ж/д накладная у грузоотправителя без отметки.

Для подтверждения 0 ставки  нам Ж/д накладные запрашиваем у грузоотправителя, где НЕ стоит отместка "ВЫПУСК РАЗРЕШЕН", тройка ж/д накладная.
Примет ли налоговая такую ж/д накладную , если доставка идет в Узбекистан и т.д. для подтверждение 0 ставки. 
И еще один важный вопрос , организация не возмещает НДС по 0 ставке.
При этом собственник вагонов тоже запрашивает ж/н для подтверждения 0 ставки, но с отметкой таможни "Выпуск разрешен" и что нам делать, если  у нас на руках остается только тройка ж/н грузоотправителя без таможенной отметки ?